空气能热水器缺点——外形较大
空气源热水器一般体积比较硕大，现今国内城市家庭普遍较小，如果在里面安装空气能热水器的话很难适用空间性，因此对于空间小的房屋，空气能热水器就不宜安装。
空气能热水器缺点——温差依赖性较大
空气能热水器对外界环境温度依赖很大，最适宜的工作环境在-5——43度之间，对于广大的南方地区来说，这并五很大的问题，但对于北方地区来说，局限性就比较大了，北方有近半的时间是处于-5度以下的，这样空气能热水器的工作效率就极差，所以在北方很少人使用。
空气能热水器缺点——一次性造价较高
相对于电热水器和燃气热水器，空气能热水器一次性造价很高，很多家庭都是在这目前望而却步的。
空气能热水器缺点——维修难
空气能热水器外形庞大，里面结构极其复杂，一旦出现了问题的话，要维修也非常的不容易，而在相对较落后的地区，甚至很难找到专业的维修处，这也局限了它的应用。
空气能热水器缺点——换热器和套管换热器易结垢断裂
空气能热水器的出水温度较高，易造成管内结垢，这样的话就容易造成水管的绽裂，从而导致其不能正常应用。